ПРЕИМУЩЕСТВА ИСПОЛЬЗОВАНИЯ СПЕЦИФИЧЕСКОГО ИНТРОНСОДЕРЖАЩЕГО БЛОКА ГЕНА NXF1 В ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИХ ИССЛЕДОВАНИЯХ

  • Дмитрий Денисович Бондарук СПбГУ
  • Елена Валерьевна Голубкова ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский Государственный Университет, Санкт-Петербург, Россия
  • Виктория Ринатовна Гинанова ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский Государственный Университет, Санкт-Петербург, Россия
  • Сергей Фёдорович Кливер ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский Государственный Университет, Санкт-Петербург, Россия
  • Людмила Андреевна Мамон ФГБОУ ВО Санкт-Петербургский Государственный Университет, Санкт-Петербург, Россия
Ключевые слова: nuclear export factor (nxf), интрон-содержащие транскрипты, некодирующие последовательности, филогенетика, эволюционно-консервативные последовательности, млекопитающие

Аннотация

Данная работа посвящена возможностям использования специфического интронсодержащего блока гена NXF1 при проведении филогенетических исследований. Интерес к перспективам использования некодирующих и интронных последовательностей при проведении филогенетических исследований значительно возрос за последнее десятилетие. Поскольку участки, соответствующие некодирующим последовательностям, способны накапливать большее количество мутаций за единицу времени, они могут эффективно использоваться для построения более точной филогении при сравнении таксонов малых порядков. Поиск последовательностей, которые могли бы использоваться для решения подобных задач все еще остается актуальной темой для исследования. Наше внимание привлек специфический интрон, входящий в состав эволюционно-консервативного блока последовательностей генов NXF1. Данный эволюционно-консервативный блок в наших предшествующих работах получил обозначение «кассетный интрон». Используя последовательность кассетного интрона, нам удалось построить филогенетическую модель, сопоставимую по точности с той, что была основана на основе последовательности митохондриального гена Cytb, более того, использование последовательности интрона позволило выявить ряд особенностей, не обнаруженных при использовании Cytb.
Опубликован
2020-12-28
Раздел
CRISPRussia2020